1956 startete der Bau der Antonie-Werr-Schule (dreistufige Mittelschule) auf dem Klostergelände. Der Internatsbau grenzte direkt an die ehemalige Haushaltungsschule an (bereits 1954 war eine Mittelschule im Klostergebäude eingerichtet worden). Schon ein Jahr später zogen 61 Mädchen ein. Das Haus beinhaltete drei Lehrsäle, einen Schreibmaschinen-, einen Zeichen- und einen Handarbeitssaal, außerdem ein Physikraum sowie Veranstaltungs- und Speisesaal, Sprechzimmer und Verwaltungsräume. In den oberen Stockwerken waren die Schlafgelegenheiten für 80 Schülerinnen. 1959 wurde aus der Mittelschule eine vierstufige Realschule und nur wenige Jahre später entschieden sich die Oberzeller Schwestern für eine neue Nutzung: die Berufsfachschule für Hauswirtschaft zog ein.

Seit Juli 1995 ist das Gebäude nun an den Montessori Trägerverein Würzburg e.V. vermietet. Kinderhort, private Grund- und Mittelschule inklusive M-Zweig und die angegliederte Fachoberschule können hier heute besucht werden.